对于国内大部分客户而言，注册日本公司的好处是可进行离岸操作，利用日本制造的高尖端品牌形象进行自身产品打品牌，提升国际形象，从而拓展国际市场；也可从事日本实地运作，或从事跨境电商贸易提供了便利途径。注册日本公司的好处主要如下：
打品牌，树立国际形象——日本的电子、汽车、医疗保健、服装、机械、化妆品、游戏等行业具有全球竞争力，在国际上具有较好的知名度，深受世界各国及国内人的好评与认可。注册同类行业的日本公司，委托授权国内企业生产包装，或从事同类型行业的国际贸易，有利于产品的推广发展，提高企业竞争力。
良好的营商环境 ——日本公司政局稳定，企业运营所需的商业环境和硬件软件设施极为发达；日本颁布了一系列利于对外贸易的政策，同大多数国家和地区进行自由贸易，为日本对外贸易规模的不断扩大创造了有利的国际市场条件。
公司注册限制较少——公司名称可自由选择，本政府均允许公司名称含有国籍，集团，控股，实业，投资，企业，协会，商会，联合会，促进会，中心，研究院，出版社，杂志社等字号。对经营范围和注册资金也没有太大的限制，如医疗保健、进出口贸易、房地产、船务运输、旅游、文化出版等在国内难注册的行业，注册的日本公司可以经营。
方便申请日本投资经营签证——注册日本公司，可以向政府申请来日经营投资签证；在日本居住满5年以上，可以申请日本国籍；在日本连续住满10年以上可获得在日本的永住权。
允许空壳公司存在——日本注册公司允许空壳公司的存在，董事无需亲自到日本就可以办理一切注册日本公司手续。
日本与中国一衣带水，是世界第三、二经济大国，经贸往来庞大；雅虎、百度、阿里巴巴等等知名企业都在日本注册公司，开拓日本市场。国内从事化妆品、餐饮、重工机械、游戏等行业，通过注册日本公司进行企业的包装，有利于产品的推广营销。
